Чтобы правильно вставить слово в предложение "James ____________ at the university since June", нужно обратить внимание на несколько ключевых моментов.

• Время: Предложение содержит слово "since", что указывает на то, что действие началось в прошлом и продолжается до настоящего момента. Это требует использования Present Perfect Continuous или Present Perfect.
• Субъект: Субъектом является "James", что подразумевает использование третьего лица единственного числа. В Present Perfect форма "have" меняется на "has".
• Форма глагола: Варианты "has working" и "have been working" не подходят по причине неправильного использования глагола. "Had been working" указывает на Past Perfect, что также не соответствует контексту.

Таким образом, правильный ответ: has been working.

Полное предложение будет выглядеть так: "James has been working at the university since June."