Чтобы правильно выбрать слово для вставки в предложение "Tom … committed the crime but we are not sure", давайте разберем каждую из предложенных опций: could have, must have и can’t have.

• Это выражение используется, когда мы говорим о возможности чего-то в прошлом.
• Если мы вставим "could have", предложение будет звучать как "Tom could have committed the crime but we are not sure". Это означает, что существует вероятность, что Том мог совершить преступление, но у нас нет уверенности.

• Это выражение используется, когда мы делаем вывод о чем-то, основываясь на имеющейся информации или доказательствах.
• Если мы вставим "must have", предложение будет звучать как "Tom must have committed the crime but we are not sure". Это подразумевает, что у нас есть сильные основания считать, что Том совершил преступление, хотя мы не можем это подтвердить.

• Это выражение используется, чтобы выразить уверенность в том, что что-то не могло произойти в прошлом.
• Если мы вставим "can’t have", предложение будет звучать как "Tom can’t have committed the crime but we are not sure". Это значит, что мы уверены, что Том не мог совершить преступление, но все равно выражаем сомнение.

Теперь, учитывая, что в предложении указано "but we are not sure", наиболее подходящим вариантом будет "could have". Это выражает возможность совершения преступления без уверенности в этом.

Ответ: Tom could have committed the crime but we are not sure.