Основной недостаток магистрально-модульного способа организации ЭВМ заключается в следующем:

1. Ограничения на разрядность шины данных: В магистрально-модульной архитектуре шина данных имеет фиксированную разрядность, что может ограничивать объем информации, передаваемой между модулями. Это может привести к узким местам в производительности, особенно при работе с большими объемами данных.
2. Невозможность отделения адресного пространства памяти от адресного пространства устройств ввода-вывода: В этой архитектуре адресное пространство для памяти и устройств ввода-вывода часто пересекается, что может усложнять управление ресурсами и вызывать конфликты при обращении к памяти и устройствам.
3. Невозможность одновременного взаимодействия более двух модулей: В магистрально-модульной архитектуре, как правило, только два устройства могут взаимодействовать одновременно через шину. Это ограничение может привести к снижению общей производительности системы, особенно в многозадачных средах.

Таким образом, из перечисленных вариантов наиболее значимым недостатком является невозможность одновременного взаимодействия более двух модулей. Это ограничение значительно влияет на эффективность работы всей системы, так как в современных вычислительных задачах важна высокая степень параллелизма.