Основными органами самоуправления в России исторически были:

• Губная изба - это орган местного самоуправления, который действовал на уровне губерний. Губные избы занимались вопросами местного управления, включая сбор налогов и организацию местной жизни.
• Земская изба - это орган, который возник в результате реформы 1864 года. Земства занимались вопросами образования, здравоохранения и благоустройства на местах.
• Поместная изба - менее известный орган, который также имел свои функции в системе местного управления, но в основном связан с управлением поместьями.
• Приказы - это органы, которые управляли различными сферами жизни, но они не были органами самоуправления в традиционном понимании.
• Боярская дума - это орган, который существовал в период феодального государства и выполнял функции совета при царе, но также не является органом самоуправления как таковым.

Таким образом, основными органами самоуправления в России можно считать губные и земские избы, так как они непосредственно занимались вопросами местного управления и самоуправления. Остальные перечисленные органы имели свои функции, но не являлись органами самоуправления в современном понимании.