Давайте разберем вопрос шаг за шагом, чтобы понять, о каких географических объектах идет речь.

1. Горная система и область складчатости: В вопросе упоминается горная система, относящаяся к области складчатости, названной в честь высочайшего горного массива зарубежной Европы. Это Алтайская горная система, которая относится к Альпийской складчатости. Альпы — это высочайший горный массив зарубежной Европы, поэтому название "Альпийская" связано с Альпами.
2. Вершина с координатами 42° с. ш. 80° в. д.: Эти координаты соответствуют пику Хан-Тенгри, который является одной из высших точек Тянь-Шаня, горной системы, связанной с Алтайской складчатостью.
3. Уникальное озеро и питающая его река: Уникальное озеро, одна часть акватории которого солоноватая, а другая пресная, — это озеро Балхаш. Оно расположено в Казахстане. Река Или, берущая начало в горах Тянь-Шаня, питает это озеро.
4. Самое крупное озеро по площади и глубине: Самое крупное озеро по площади и глубине в пределах данной горной системы — это озеро Иссык-Куль. Оно расположено в Киргизии и находится в пределах Тянь-Шаня.
5. Столица с названием Фрунзе в XX веке: Столицей, которая в XX веке носила название Фрунзе, является Бишкек, столица Киргизии.

Таким образом, мы разобрали каждый элемент вопроса и нашли соответствующие географические объекты.