Давайте разберемся с зарядом аминокислот в зависимости от pH и как составить пентапептид.
1. Изменение заряда нейтральных аминокислот (например, серин) в зависимости от pH:
- Нейтральные аминокислоты, такие как серин, имеют аминогруппу (-NH2) и карбоксильную группу (-COOH).
- При низком pH (кислой среде) карбоксильная группа протонируется и становится -COOH, а аминогруппа остается в форме -NH3+. В результате аминокислота будет иметь положительный заряд.
- При нейтральном pH (около 7) карбоксильная группа теряет протон и превращается в -COO-, а аминогруппа остается в форме -NH3+. В этом состоянии аминокислота имеет нулевой заряд (зета-потенциал).
- При высоком pH (щелочной среде) аминогруппа также теряет протон и становится -NH2, что приводит к отрицательному заряду аминокислоты.
2. Изменение заряда кислых аминокислот (например, аспарагиновой кислоты):
- Аспарагиновая кислота является кислой аминокислотой и имеет две карбоксильные группы и одну аминогруппу.
- При низком pH обе карбоксильные группы будут в форме -COOH, а аминогруппа - в форме -NH3+, что придаст аминокислоте положительный заряд.
- При нейтральном pH одна карбоксильная группа будет в форме -COO-, а другая -COOH, что приведет к нулевому заряду.
- При высоком pH обе карбоксильные группы будут в форме -COO-, а аминогруппа - в форме -NH2, что придаст аминокислоте отрицательный заряд.
3. Изменение заряда основных аминокислот (например, лизина):
- Лизин является основной аминокислотой и имеет одну аминогруппу на боковой цепи.
- При низком pH аминогруппы будут протонированы, и лизин будет иметь положительный заряд.
- При нейтральном pH аминогруппа на боковой цепи останется в форме -NH3+, что также придаст положительный заряд.
- При высоком pH аминогруппа на боковой цепи теряет протон и становится -NH2, что приведет к нейтральному заряду.
4. Составление пентапептида из аминокислот:
Чтобы составить пентапептид, нужно соединить пять аминокислот через пептидные связи. В нашем случае это:
- Глутаминовая кислота
- Метионин
- Пролин
- Валин
- Гистидин
Процесс выглядит следующим образом:
- Начинаем с первой аминокислоты (глутаминовая кислота) и добавляем к ней вторую (метионин). Образуется пептидная связь между карбоксильной группой первой аминокислоты и аминогруппой второй.
- Затем добавляем третью аминокислоту (пролин) к образовавшемуся пептиду, снова формируя пептидную связь.
- Повторяем процесс с четвертой (валин) и пятой (гистидин) аминокислотами, каждую раз образуя пептидные связи.
В результате мы получаем пентапептид, состоящий из пяти аминокислот, связанных между собой.