Чтобы правильно завершить фразу, давайте разберемся с терминами "молекула" и "атом".
Атом - это наименьшая единица химического элемента, которая сохраняет его свойства. Например, атом йода - это отдельная частица, которая не может существовать в свободном состоянии в нормальных условиях.
Молекула - это группа атомов, связанных между собой. В случае йода, его молекулы могут состоять из двух атомов йода, так как йод в природе чаще всего встречается в виде двухатомной молекулы (I2).
Теперь вернемся к фразе: "Запах йодной настойки обусловливается испарением из неё ......... йода". Поскольку мы говорим о запахе, который ощущается при испарении, мы имеем в виду, что в воздух попадают молекулы йода.
Таким образом, правильным термином для завершения фразы будет молекула, так как запах обусловлен именно испарением молекул йода.
Итак, полная фраза будет звучать так: "Запах йодной настойки обусловливается испарением из неё молекул йода".