Разберем оба предложения, чтобы понять разницу в их грамматической структуре.

• Первое предложение: "Кажется, что ей не больше шестнадцати лет".
• В этом предложении присутствует союз "что", который вводит придаточную часть.
• Структура предложения: Главное предложение ("Кажется") + Придаточное предложение ("что ей не больше шестнадцати лет").
• Это делает предложение более формальным и подчеркивает, что информация о возрасте является следствием некоего мнения или предположения.
• Второе предложение: "Кажется, ей не больше шестнадцати лет".
• Здесь отсутствует союз "что", и мы имеем дело с прямым высказыванием.
• Структура: Главное предложение ("Кажется") + Прямое дополнение ("ей не больше шестнадцати лет").
• Это делает предложение менее формальным и более разговорным, создавая ощущение непосредственного утверждения.

Таким образом, основное различие заключается в том, что первое предложение использует союз "что" для соединения главного и придаточного предложений, в то время как второе предложение является более простым и разговорным, не требуя дополнительного соединительного элемента.