Чтобы правильно выбрать слово для заполнения пропуска в предложении «Падежные формы имён существительных образуются при помощи _____________________.», давайте разберёмся с каждым из предложенных вариантов.

• Окончаний - это правильный вариант. Падежные формы существительных действительно образуются при помощи окончаний. Например, в именительном падеже слово "стол" имеет окончание - "стол", а в родительном падеже - "стола".
• Вопросов - этот вариант не подходит. Хотя вопросы помогают определить падеж существительного, они не образуют падежные формы сами по себе.
• Разных частей слова - этот вариант тоже не является правильным. Падежные формы зависят от окончания, а не от частей слова, таких как корень или приставка.

Таким образом, правильный ответ - это окончаний.