Чтобы правильно расставить запятые в данном предложении, давайте разберем его структуру и выделим главные части.

Предложение состоит из нескольких частей, которые мы можем разделить на основные и пояснительные. Основная часть - это "Дубна - это город на севере Московской области". Остальные части служат для пояснения и описания города Дубна.

• Первая часть: "Дубна - это город на севере Московской области". Здесь запятая не нужна, так как это простое предложение с основным сообщением.
• Вторая часть: "наукоград", "крупнейший в России", "центр по исследованиям в области ядерной физики". Эти части являются пояснительными и должны быть обособлены запятыми.

Теперь давайте посмотрим, как правильно расставить запятые:

1. После "области" ставим запятую, так как далее идет пояснение: "наукоград".
2. После "наукоград" также ставим запятую перед следующей пояснительной частью: "крупнейший в России".
3. И, наконец, перед "центр по исследованиям в области ядерной физики" также ставим запятую.

Таким образом, правильный вариант предложения будет выглядеть так:

Дубна - это город на севере Московской области, наукоград, крупнейший в России, центр по исследованиям в области ядерной физики.

Запятые используются для разделения однородных членов и пояснительных конструкций, что делает текст более понятным и структурированным.