В данном случае нам нужно определить, в каком предложении оба выделенных слова пишутся раздельно. Для этого давайте разберём каждое из выделенных слов и их контекст.

• Это слово является прилагательным, которое образовано от глагола "защитить".
• Прилагательные с частицей "не" пишутся слитно, если они употребляются в значении "не защищённый", то есть в отрицательном значении.
• В данном случае "не защищённый" - это именно то, что мы имеем в виду, поэтому "НЕЗАЩИЩЁННОМ" пишется слитно.

• Это слово также является прилагательным, образованным от глагола "полить".
• Прилагательные с частицей "не" пишутся раздельно, если они употребляются в значении "не политы", то есть в прямом значении.
• В данном контексте "не политы" подразумевает, что цветы не были политы вовремя, и поэтому "НЕПОЛИТЫ" пишется раздельно.

Таким образом, в предложении "Почему цветы на подоконнике, (НЕ)ЗАЩИЩЁННОМ от солнца, (НЕ)ПОЛИТЫ вовремя?" слово "НЕЗАЩИЩЁННОМ" пишется слитно, а "НЕПОЛИТЫ" - раздельно. Поэтому оба выделенных слова не пишутся раздельно.

Ответ: в данном предложении оба выделенных слова пишутся по-разному: "НЕЗАЩИЩЁННОМ" - слитно, "НЕПОЛИТЫ" - раздельно.