Чтобы правильно выбрать форму глагола, нужно учесть временные маркеры и контекст предложения. В этом случае у нас есть временной маркер "for two hours", который указывает на продолжительность действия.

Давайте рассмотрим три предложенные формы глагола:

1. had been waiting: Эта форма используется для описания действия, которое продолжалось в прошлом до какого-то момента или события. Она не подходит в данном контексте, так как мы говорим о настоящем времени.
2. have been waiting: Эта форма используется в настоящем перфектном продолженном времени (Present Perfect Continuous) и описывает действие, которое началось в прошлом и продолжается до настоящего момента. Это наиболее подходящий вариант в данном предложении, так как он показывает, что ожидание началось два часа назад и продолжается до настоящего времени.
3. am waiting: Эта форма используется в настоящем продолженном времени (Present Continuous) и описывает действие, происходящее в данный момент. Однако она не указывает на продолжительность, поэтому менее подходит для данного контекста.

Таким образом, наиболее подходящая форма глагола в данном предложении будет: have been waiting.

Полное предложение будет звучать так: "I hope Kate is coming soon. I have been waiting for two hours."